在饮料厂食品生产许可证办理过程中，如果产品检验不合格，应采取以下处理措施：

一、风险控制与整改

1. 立即封存：一旦发现不合格品，应立即封存库存中的相关问题食品，防止其继续流通。

2. 暂停生产销售：暂停生产、销售和使用问题食品，以避免不合格产品进一步影响市场。

3. 召回已售产品：对于已经销售出去的问题食品，应尽快启动召回程序，问题产品不再流通，控制食品安全风险。

4. 排查整改：排查问题发生的原因，针对问题进行整改，类似问题不再发生。这包括检查生产设备、工艺流程、原料购买等方面，所有环节都符合食品安全标准。

二、报告与配合

1. 报告监管部门：及时向住所地的食品药品监督管理部门报告相关处理情况，以便监管部门及时掌握情况并采取相应措施。

2. 配合调查：积极配合监管部门的调查，提供必要的文件和资料，以便监管部门对不合格品进行进一步的处理和调查。

三、法律责任与处罚

1. 接受处罚：对于违反《食品安全法》及相关规定，导致食品不合格的生产经营者，食品药品监督管理部门将依法进行处罚。处罚措施可能包括警告、没收违法所得、违法经营的食品以及用于违法经营的工具、设备、原料等物品，并可能处以罚款。

2. 加强内部管理：为了避免类似问题的再次发生，饮料厂应加强内部管理，建立完善的食品安全管理体系，从原料购买到产品销售的每一个环节都符合食品安全标准。

四、具体案例参考

以某饮料厂因生产定量包装商品净含量不合格被处罚的案例为例，该厂在生产过程中由于设备故障导致产品净含量有误差，经检验不合格后被监管部门处罚。该案例提醒饮料厂在生产过程中应严格控制设备质量，产品净含量符合规定要求。

，饮料厂在食品生产许可证办理过程中应严格遵守相关法律法规和标准要求，产品质量安全。一旦发现不合格品，应立即采取风险控制与整改措施，并报告监管部门、配合调查处理。同时，加强内部管理、完善食品安全管理体系也是预防不合格品发生的重要措施。