在医疗器械洁净厂房装修中，为了避免交叉污染，应采取以下措施：

严格的洁净级别划分：根据医疗器械的生产要求，合理划分不同洁净级别的区域，生产区域的洁净度符合生产产品的要求。

单向流动的空气流向设计：采用单向流空气净化系统，空气从清洁区域向污染区域流动，避免气流逆向导致的交叉污染。

高效的过滤系统：在空气净化系统中安装高效过滤器（如HEPA或ULPA），以去除空气中的尘埃、微生物等污染物。

严格的人流和物流控制：设立专门的人员进出通道和物料搬运通道，避免人员和物料在不同洁净区域间直接交叉。

定期清洁和消毒：制定严格的清洁和消毒计划，对洁净厂房的地面、墙面、天花板、设备等进行定期清洁和消毒。

使用一次性或可消毒的包装材料：在生产过程中使用一次性或可以高温消毒的包装材料，减少污染源的传播。

员工培训和健康管理：对进入洁净厂房的员工进行严格的健康检查和必要的无菌操作培训，员工的个人卫生和操作规范。

废弃物处理系统：建立有效的废弃物收集和处理系统，废弃物在收集、运输和处理过程中不造成交叉污染。

设备和工具的清洁和消毒：对生产设备和工具进行定期清洁和消毒，避免设备和工具成为污染传播的媒介。

环境监测：定期对洁净厂房的温湿度、压差、微生物等环境参数进行监测，生产环境符合生产要求。

通过以上措施，可以大大降低医疗器械洁净厂房装修过程中的交叉污染风险，医疗器械的生产质量和安全。