化妆品万级洁净车间装修中的常见问题主要包括以下几个方面：

1. 净化车间布局不合理：车间布局未能与生产工艺流程相匹配，可能导致人流和物流交叉污染，影响生产效率和产品质量。

2. 材料选择不当：在选择内墙、地板、天花板、通风管道等材料时，未能充分考虑到其耐腐蚀、易清洁、不产尘等特性，可能导致尘埃和微生物滋生，影响车间的洁净度。

3. 操作间分隔不严密：各个操作间之间的分隔不够严密，可能导致不同操作区域之间的交叉污染，影响产品质量。

4. 空气消毒设备配置不当：消毒设备的配置和使用不当，可能导致车间内空气中的微生物过多，影响车间的洁净度和产品质量。

5. 施工不当：施工过程中未能严格按照施工规范进行操作，可能导致尘埃和污染物进入车间，影响车间的洁净度。

6. 忽视人员进出管理：未能对进出车间的人员进行严格的清洁和检查，可能导致外界尘埃和污染物进入车间，影响车间的洁净度。

为了避免这些问题的发生，建议在装修前进行充分的规划，选择有经验的施工团队，使用符合要求的材料，并严格执行施工规范。同时，定期对车间进行维护和清洁，车间的洁净度和产品质量。