湖南消毒产品生产企业办理卫生许可证时，应提交的体系文件主要包括但不限于以下几个方面：

一、基本申请材料

1. 《消毒产品生产企业卫生许可证》申请表：详细填写企业基本信息、生产产品种类、生产工艺等关键内容。

2. 工商营业执照复印件或企业名称预先核准通知书：证明企业的合法经营资格。

3. 生产场地使用证明（房屋产权证明和租赁协议）：证明企业拥有合法的生产场所。

二、生产与检验相关文件

1. 生产厂区平面图、生产车间布局平面图：展示企业的生产环境和车间布局情况。

2. 生产工艺流程图：详细说明消毒产品的生产工艺流程。

3. 生产和检验设备清单：列出企业所拥有的生产和检验设备，其符合生产要求。

4. 质量保障体系文件：包括企业为产品质量而建立的一系列管理制度、操作规程、检验标准等文件。

三、产品相关文件

1. 拟生产产品目录：列出企业计划生产的消毒产品种类。

2. 产品卫生质量检测报告：提供产品的卫生质量检测报告，证明产品符合相关卫生标准。

四、其他必要的体系文件

1. 生产环境和生产用水检测报告：生产环境和生产用水符合卫生要求。

2. 卫生管理员和检验人员的资质证明：包括健康证明、培训证明等，相关人员具备必要的资质和能力。

3. 新建、改建、扩建工程的生产企业现场审核意见书（如有）：对于新建、改建、扩建的生产企业，需提供相关部门出具的现场审核意见书。

五、延续与变更申请材料（如适用）

若企业需要延续或变更卫生许可证，还需提交相应的申请材料，如延续申请表、变更申请表、变更证明材料等。

注意事项

所有申请资料应一式两份，其中原件1份，复印件1份，并复印件与原件完全一致。

申请资料应使用A4规格纸张打印，并按照规定的格式和要求填写。

所有申请资料应逐页加盖申请单位公章，如企业未有公章，法定代表人或负责人须逐页签名。

申请人委托他人提交申请材料的，应同时提交《授权委托书》及被委托人的身份证明复印件。

请注意，以上信息仅供参考，具体申请材料和要求可能因政策调整而有所变化。建议企业在办理前，先咨询当地省级卫生行政部门或相关，以获取较新的办理指南和要求。